Il vacuolo nelle alghe è in una grande cavità riempita di liquido ed occupa la maggior parte (fino al 90%) del volume dell’alga. Il citoplasma (la sostanza base liquida e simile ad un gel dentro alla cellula) con gli organelli cellulari contenenti viene spinto completamente alla parete della cellula. Il vacuolo è circondato da una membrana che si chiama il tonoplasto. 

Il vacuolo serve alla conservazione di ioni, zuccheri, vitamine, ecc. Spesso si possono trovare cristalli o grani di amido. L’elevate concentrazioni di sostanze consentono alle cellule algali di assimilare l’acqua circostante (osmosi). Tramite il riempimento sodo (il turgore massimo) con un liquido la cellula algale mantiene la sua forma.

Attraverso gli ultrasuoni le alghe muoiono dopo 2 a 3 settimane in un modo naturale. Tramite il gas metano che si trova nelle alghe, loro con esso salgono in superfice. Con la pioggia il metano svanisce ed i resti dell'alga morta affondano al suolo.